No sé que versión de Nero tienes. Yo utililo la 6, que cumple perfectamente la grabación de audio y video. Aquí, marcas la casilla de CD y te vas a la opción "Codificar archivos de audio". Te saldrá una ventana y verás que tienes la pestañita "añadir" para ir introduciendo todos los archivos mp3 que quieras. Abajo, en formato de salida, tienes que buscar el que pone "Windows Media Audio (wma) o el que desees. Y en Archivo de Destino eliges el lugar donde se te guardarán ya tus nuevos archivos convertidos al formato seleccionado. Finalmente, le das a la opción "continuar" para que se inicie el proceso. Eso es todo.