El
windows movie maker que viene con windows es muy fácil de usar y te permite hacerlo, sólo debes pausar el video en el momento de inicio de la escena que quieres cortar, y clickear dividir o cortar clip, tendrás dos videos, luego al segundo video (que empieza en la escena a cortar) lo pausas cuando termina lo que quieres cortar, y lo divides otra vez, luego cortas ese fragmento del medio (la escena que no querías), y vuelves a unir las otras dos partes, parece complejo pero es bastante sencillo.