Hay vairas formas puedes hacerlo con un cd o diskette de arranque de win98, por DOS formateas el disco duro o en todo caso
particiona tu disco, con el Disk Manager, es un programa sencilo y facil de usar, uan vez formateado puedes instalar el sistema desde un nuevo cd.
Pero tambien puedes hacerlo con el mismo cd del XP, selecciona cuando carga arranque desde CD, luego elimina la particiona creada y crea una nueva, sigue los pasos de una forma normal, como siempre se instala el XP, no deberias tener problemas, y si no te permite instalar el XP, puede ser q tu disco este dañado o tu memoria este averiada, descarta todas las posiblidades y nos comentas.